Чл. 12 ЗСОМФ

свиква конгрес;

осигурява изпълнението на решенията на конгреса;

управлява имуществото на организацията;

създава и води националния регистър на членовете си почл. 5, ал. 1, т. 4и обнародва в "Държавен вестник" списък с имената на лицата, регистрирани да упражняват професията, като списъкът се актуализира ежегодно и се обнародва в "Държавен вестник";

осигурява защита на данните в регистъра от неправомерен достъп;

ръководи дейността на БФС по изпълнението на неговите функции;

избира и освобождава представителите на съсловната организация във Висшия медицински съвет и Висшия съвет по фармация към министъра на здравеопазването;

предоставя на Министерството на здравеопазването информацията почл. 185, ал. 3 и 4 от Закона за здравето.

приема правила за водене и поддържане на регистрите на членовете на БФС;

осъществява други дейности, предвидени в устава на организацията;

оказва съдействие на държавните органи, органите на съдебната власт и на длъжностни лица при или по повод изпълнение на техните правомощия;

осъществява други дейности, посочени в закон.