Чл. 7 ПУДНЦЗПБ

организира, ръководи и контролира цялостната дейност на центъра и го представлява пред всички държавни органи, учреждения, организации, физически и юридически лица в страната и в чужбина;

в изпълнение на своите задължения издава заповеди и инструкции;

определя вътрешната структура на центъра на базата на утвърдената численост на персонала и този правилник;

разпорежда се със средствата, предоставени му от бюджета като второстепенен разпоредител, както и със средствата от собствена научна, научно-приложна, учебна, диагностична и експертна дейност, носи отговорност за тяхното управление и за законосъобразното им разходване;

утвърждава правилника за вътрешния ред; инструкцията за документооборота, деловодната и архивната дейност; системата за финансово управление и контрол; инструкцията за работа при здравословни и безопасни условия на труд, длъжностните характеристики на служителите и други вътрешни актове;

сключва договори в областите на дейност и управление на центъра;

създава със заповед обособени екипи на функционален принцип за изпълнение на конкретни дейности;

издава удостоверения за завършено обучение в случаите, предвидени в нормативен акт;

осъществява и други дейности по управление на центъра;

изпълнява други задачи, възложени му от министъра на здравеопазването.